חומרים מסוכנים הם חומרים שקיומם מאיים על בריאותו של האדם, על סביבתו ועל רכושו. איום זה אינו מוגבל לבטיחות בלבד אלא משפיע על הקרקע ועל מי-התהום, על הים ועל חופיו ועל איכות האוויר בהווה ובעתיד.
האגף לחומרים מסוכנים מתמודד עם האיום הזה באמצעות רישוי, פיקוח על העוסקים בחומרים מסוכנים וקידום חקיקה המסדירה את השימוש בחומרים אלה.